Inclusão de covariáveis em modelos de seleção genômica ampla para acurácia de predição

Resumo

O objetivo deste trabalho foi avaliar modelos que utilizam os nucleotídeos de polimorfismo único significativos (SNPs), encontrados por seleção assistida por marcadores e associação genômica, como um efeito fixo em modelos comumente utilizados na seleção genômica ampla para a população F2, em comparação com o modelo que utiliza todos os SNPs. Utilizou-se para todos modelos o método bayesiano de regressão de crista. Para as comparações entre os modelos, avaliaram-se a capacidade de predição fenotípica e genotípica, a acurácia fenotípica, o ganho de seleção, o índice de coincidência e o tempo de processamento. Ambos os métodos não conseguiram identificar com precisão os verdadeiros loci de características quantitativas (QTL). A seleção baseada apenas nos QTL identificados pelos métodos avaliados elegeu indivíduos de baixo valor genético. O uso de um modelo de seleção genômica ampla –com os SNPs significativos encontrados pela associação genômica como um efeito fixo, e os SNPs restantes como um efeito aleatório – foi a estratégia adequada para selecionar indivíduos superiores com alta precisão. A introdução de QTL já descritos para uma dada característica no modelo de seleção genômica ampla permite a seleção de indivíduos superiores com maior precisão.