Desempenho de quatro métodos de seleção genômica com uso de diferentes herdabilidades e números de QTL

Resumo

O objetivo deste trabalho foi avaliar como a herdabilidade e o número de locos de características quantitativas (QTL) que controla a característica podem influenciar na predição do valor genético por meio de métodos de seleção genômica. Uma equação de predição foi estabelecida para estimar a correlação genética baseada na correlação fenotípica, tendo-se utilizado uma população F2 com 1.000 indivíduos, simulados em diferentes cenários. A herdabilidade (5, 20, 40, 60, 80 e 99%) e o número de QTL (60, 120, 180 e 240) variaram em cada cenário. Os quatro seguintes métodos de seleção genômica foram utilizados nas análises: ridge-regression best linear unbiased prediction (RR-BLUP), BLUP genômico (GBLUP), método bayesiano de estimação B (Bayes B) e reproducing kernel Hilbert spaces regression (RKHS). As habilidades preditivas fenotípicas e genotípicas foram calculadas para cada método, e o teste de Tukey foi utilizado para comparação de médias. O efeito da herdabilidade e do número de QTL que controla a característica foi avaliado por análise de regressão. O teste de Tukey revelou diferenças entre os métodos, sendo que Bayes B e RR-BLUP foram superiores aos demais em quase todos os cenários. A herdabilidade apresenta relação linear positiva com a capacidade preditiva fenotípica e relação quadrática positiva com a capacidade preditiva genotípica. O número de QTL controlando a característica não tem relação com a capacidade preditiva fenotípica e genotípica.