Incidência de Garlic common latent virus na Argentina, e análise filogenética e de recombinação de isolados

Resumo

O objetivo deste trabalho foi estimar a incidência e a prevalência de Garlic common latent virus (GarCLV) nas principais regiões produtoras de alho (Allium sativum) da Argentina, e realizar análises filogenética e de recombinação de isolados dessas regiões. Amostras foliares (3.050) foram coletadas de quatro tipos comerciais de alho, em 13 departamentos, nas quatro principais províncias produtoras de alho na Argentina, em uma área amostrada de 1.175 ha. A infecção viral foi avaliada pelo teste DAS‑Elisa com antissoro específico, e as análises filogenética e de recombinação foram feitas com sequências de nucleotídeos da proteína capsidial (CP) de sete isolados das províncias. A incidência de GarCLV nas províncias avaliadas variou de 6,7 a 22% das amostras, enquanto a prevalência variou de 52,6 a 70%. Na avaliação dos tipos comerciais de alho, Morado apresentou as maiores incidências do vírus, na Província de San Juan, enquanto Rosado Paraguayo apresentou a menor incidência, na Província de Córdoba. A identidade de nucleotídeos nas sequências de CP variou entre 80,3 e 97,6%. A análise filogenética mostra a presença de dois grupos principais de GarCLV e de um possível terceiro grupo formado por apenas um isolado da Alemanha. A análise de recombinação entre isolados de diferentes partes do mundo evidencia a presença de isolados recombinantes da Polônia e da Austrália.